深度測(cè)序技術(shù)稱(chēng)為深度測(cè)序（deepsequencing），是因?yàn)樗菍?duì)傳統(tǒng)測(cè)序技術(shù)的一次性改變，它通過(guò)一次性對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定（之前只是幾十至多幾千個(gè)堿基），同時(shí)，如此的高通量測(cè)序使得對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全方面的分析成為可能。你以為深度測(cè)序只是一種“養(yǎng)”在實(shí)驗(yàn)室“深閨”中摸不著、看不透的高精尖技術(shù)？錯(cuò)！錯(cuò)！錯(cuò)！深度測(cè)序技術(shù)的巨大發(fā)展，與計(jì)算機(jī)的發(fā)展歷程有著類(lèi)似之處，它將對(duì)人類(lèi)的科學(xué)、經(jīng)濟(jì)和社會(huì)三個(gè)方面產(chǎn)生深遠(yuǎn)的影響。病毒全基因組測(cè)序具有的特點(diǎn)：采用高通量測(cè)序儀，全流程質(zhì)控。DNA二代測(cè)序方法

探普生物進(jìn)行病毒基因組測(cè)序的流程：在探普生物進(jìn)行病毒基因組測(cè)序非常簡(jiǎn)單，簡(jiǎn)而言之，客戶只需要說(shuō)清楚樣品情況，準(zhǔn)備樣品即可，其他事宜都由探普來(lái)進(jìn)行安排。大致流程如下：1)與銷(xiāo)售人員溝通項(xiàng)目需求和樣本情況；2)探普生物工作人員擬定項(xiàng)目合同，雙方協(xié)商合同內(nèi)容后簽字蓋章；3)按樣本準(zhǔn)備指南準(zhǔn)備好樣本，填寫(xiě)信息單后通知銷(xiāo)售人員預(yù)訂干冰，安排樣本寄運(yùn)輸；4)客戶支付項(xiàng)目啟動(dòng)款，探普生物啟動(dòng)項(xiàng)目實(shí)驗(yàn)和分析并提供測(cè)序報(bào)告；5)客戶支付項(xiàng)目尾款，探普生物提交測(cè)序數(shù)據(jù)和分析結(jié)果；6)售后問(wèn)題處理，項(xiàng)目結(jié)題。DNA二代測(cè)序方法目前對(duì)病毒溯源分型主要檢測(cè)手段就是高通量測(cè)序技術(shù)。

探普生物對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的實(shí)驗(yàn)基于二代測(cè)序技術(shù)。樣本經(jīng)過(guò)核酸純化-文庫(kù)構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這3大基本流程后轉(zhuǎn)換成了序列數(shù)據(jù)。先，在核酸純化環(huán)節(jié)，探普提供專(zhuān)門(mén)針對(duì)性的核酸純化樣本指南，以提高目的物種的核酸純度和得率，與此同時(shí)探普生物也提供核酸純化服務(wù)。第二，文庫(kù)構(gòu)建環(huán)節(jié)，樣本的核酸具備濃度低，總量少的特點(diǎn)。探普生物專(zhuān)門(mén)針對(duì)這一點(diǎn)開(kāi)發(fā)了超微量核酸文庫(kù)構(gòu)建，可以將0.01ng/μl甚至更低濃度的核酸構(gòu)建成測(cè)序文庫(kù)。第三，生物信息學(xué)分析環(huán)節(jié)。生存環(huán)境和狀態(tài)決定了對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的下機(jī)數(shù)據(jù)一般都伴隨大量的宿主和其他微生物的數(shù)據(jù)。探普生物基于該特點(diǎn)，優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫(kù)，搭載了的生物信息學(xué)分析流程，可處理復(fù)雜背景下的目標(biāo)物種序列。

病毒全基因組測(cè)序，高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展在生物信息學(xué)分析方面，通過(guò)新的分析軟件的研發(fā)和原有分析軟件的升級(jí)，對(duì)測(cè)序所得數(shù)據(jù)的分析也變得更加可靠；除此之外，伴隨著B(niǎo)asSpace等服務(wù)的出現(xiàn)，進(jìn)行數(shù)據(jù)分析工作所需的設(shè)備成本也在逐步降低。將來(lái)，伴隨著高通量測(cè)序技術(shù)與數(shù)據(jù)分析技術(shù)的不斷進(jìn)步，測(cè)序精度與可靠性的上升，測(cè)序與數(shù)據(jù)分析成本的下降，高通量測(cè)序技術(shù)會(huì)在各個(gè)領(lǐng)域得到應(yīng)用。在病原微生物檢測(cè)和鑒定應(yīng)用中，高通量測(cè)序技術(shù)勢(shì)必會(huì)成為不可或缺的技術(shù)并發(fā)揮越來(lái)越重要的作用。高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)足夠靈敏和完善，方能獲得準(zhǔn)確、可信任的結(jié)果。分析不同大小和不同樣品類(lèi)型的UViGs對(duì)于探索病毒基因組序列空白是有價(jià)值的。

深度測(cè)序技術(shù)對(duì)經(jīng)濟(jì)市場(chǎng)的影響：未來(lái)社會(huì)的創(chuàng)新驅(qū)動(dòng)將由信息技術(shù)向心理社會(huì)健康方面轉(zhuǎn)移。可以預(yù)見(jiàn)，全球老年化社會(huì)到來(lái)后的經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場(chǎng)將是健康行業(yè)，而以基因測(cè)序預(yù)測(cè)健康和臨床準(zhǔn)確分型的市場(chǎng)將會(huì)越來(lái)越大。深度測(cè)序相關(guān)的經(jīng)濟(jì)市場(chǎng)有兩個(gè)方面。一是測(cè)序儀器和技術(shù)相關(guān)的市場(chǎng)，二是測(cè)序應(yīng)用市場(chǎng)的競(jìng)爭(zhēng)。一個(gè)顯見(jiàn)的例子是，近年來(lái)深度測(cè)序技術(shù)促進(jìn)了對(duì)肺病的進(jìn)一步認(rèn)識(shí)和分型，更多的位點(diǎn)突變?nèi)鏏LK、ERCC1、MET、PI3K、RRM1等被陸續(xù)發(fā)現(xiàn)，多基因檢測(cè)肺病致病驅(qū)動(dòng)基因?qū)︶t(yī)生準(zhǔn)確選擇靶向藥物十分重要。以肺病中常見(jiàn)的EGFR突變型為例，對(duì)于敏感性基因突變（19Del+L858R），第1代靶向藥物（如易瑞沙等）可以進(jìn)行良好的調(diào)整和控制；但是對(duì)于耐藥性基因突變（T790M），則需要第三代靶向藥物（AZD9291）才有較好的臨床效果。不久的將來(lái)，病癥患者將獲得更具個(gè)性化的藥物，從而達(dá)到準(zhǔn)確醫(yī)療。全基因組測(cè)序能檢測(cè)個(gè)體基因組中的全部遺傳信息，準(zhǔn)確性高。DNA二代測(cè)序方法

病毒全基因組測(cè)序基于PCR技術(shù)和抗原抗體技術(shù)的售后驗(yàn)證平臺(tái)，致力于解決臨床的每一個(gè)疑問(wèn)。DNA二代測(cè)序方法

病毒基因組測(cè)序的標(biāo)準(zhǔn)有：測(cè)序的完成程度，決定著基因組的下游應(yīng)用，包括設(shè)計(jì)診斷產(chǎn)品、反向遺傳系統(tǒng)以及開(kāi)發(fā)調(diào)整對(duì)策等。研究團(tuán)隊(duì)希望能夠通過(guò)五條標(biāo)準(zhǔn)來(lái)填補(bǔ)這樣的空白，這些標(biāo)準(zhǔn)涵蓋了完成病毒基因組的整個(gè)階段，使用不依賴(lài)測(cè)序技術(shù)的簡(jiǎn)單條件規(guī)定了五個(gè)類(lèi)別。不同的測(cè)序技術(shù)可能會(huì)很快淘汰更新，因此我們這些標(biāo)準(zhǔn)沒(méi)有關(guān)聯(lián)任何特定的測(cè)序平臺(tái)，可以長(zhǎng)時(shí)間的使用下去。一種基于二代測(cè)序的pedv病毒基因組分析方法。目前現(xiàn)有的pedv分析方法兩方面的局限，第1，pedv病毒二代測(cè)序數(shù)據(jù)中存在部分甚至大量的宿主豬的基因組序列，宿主基因組的污染會(huì)影響pedv病毒基因組的拼接。第二，拼接預(yù)測(cè)病毒基因結(jié)構(gòu)的方法主要是genemarks等預(yù)測(cè)軟件，但由于pdev病毒基因組中基因相互重疊，其中基因內(nèi)部還存在ribosomalframeshift現(xiàn)象，現(xiàn)有的基因預(yù)測(cè)軟件并不能準(zhǔn)確識(shí)別出正確的基因結(jié)構(gòu)。DNA二代測(cè)序方法