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貴陽丙二酰化修飾蛋白質組學分析

貴陽丙二?;揎椀鞍踪|組學分析

更新時間:2025-12-16

簡要描述: 蛋白質翻譯后修飾:蛋白質翻譯后修飾 (Protein translational modifications,PTMs)

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蛋白質翻譯后修飾:蛋白質翻譯后修飾 (Protein translational modifications,PTMs) 通過功能基團或蛋白質的共價添加、調節(jié)亞基的蛋白水解切割或整個蛋白質的降解來增加蛋白質組的功能多樣性。這些修飾包括磷酸化、糖基化、泛素化、亞硝基化、甲基化、乙酰化、脂質化和蛋白水解,幾乎影響正常細胞生物學和發(fā)病機制的所有方面。因此,識別和理解 PTM 在細胞生物學和疾病療理和預防的研究中至關重要。蛋白質翻譯后修飾 (PTMs) 進一步促進了從基因組水平到蛋白質組復雜性的增加。PTMs 是一種化學修飾,在功能蛋白質組中發(fā)揮關鍵作用,因為它們調節(jié)活性、定位以及與其他細胞分子(如蛋白質、核酸、脂質和輔助因子)的相互作用。已知的蛋白質翻譯后修飾種類有20多種。貴陽丙二?;揎椀鞍踪|組學分析

蛋白質糖基化修飾組學技術怎么確定位點?蛋白質經(jīng)過酶解后利用凝集素(lectin)富集N-糖基化肽段,然后用N-糖酰胺酶(PNGase)在H218O中切除連接在天冬酰胺殘基(Asn)上的糖鏈。該處理致使Asn分子量增加2.9890Da。之后用高精度LC-MS質譜儀檢測脫糖后的肽段,并通過MASCOT軟件檢索數(shù)據(jù)庫,確認脫糖后分子量與其理論分子量的變化以及糖基化修飾肽段的序列,從而確定該蛋白質的N-糖基化位點。琥珀?;揎椀鞍踪|組技術特點:采用主流抗體親和富集方法,特異性高,富集效率好。貴陽丙二?;揎椀鞍踪|組學分析蛋白質磷酸化修飾可應用于食品工業(yè)方面。

乙?;揎椀鞍捉M學實驗流程:1)組織/細胞破碎,提取蛋白質;2)蛋白酶解成多肽片段;3)對多肽片段進行 iTRAQ 標記;4)高效特異性乙?;贵w富集乙?;揎楇亩?;5)使用 LC-MS/MS 對富集的乙?;亩芜M行序列分析;5)數(shù)據(jù)分析,比對不同樣本中蛋白乙酰化修飾水平差異,并對產(chǎn)生變化的生物學意義進行解釋。乙酰化是一個普遍而重要的蛋白質翻譯后修飾,不僅集中在對細胞染色體結構的影響以及對核內轉錄調控因子方面,而且還影響參與細胞周期和新陳代謝、肌動蛋白聚合控制及多聚谷氨酰胺疾病等方方面面。乙?;粌H存在于真核細胞中,而且越來越多的證據(jù)也表明乙?;瑯佑绊懺S多原核細胞的生理生化過程。

泛素化修飾蛋白質組學技術原理:盡管質譜儀器的分析能力近年來有了長足的發(fā)展,但是由于蛋白翻譯后修飾化學計量值低、復雜性大,直接將蛋白組(如全細胞裂解產(chǎn)物,組織勻漿產(chǎn)物或全血清蛋白)的酶解肽段送入質譜鑒定和定量PTM是非常困難的。因此,很多翻譯后修飾的富集方法會被采用,來提高樣品中PTM肽段的豐度和相對比例,從而提高了質譜對翻譯后修飾位點的鑒定效率。研究發(fā)現(xiàn)在泛素化修飾的蛋白在tyrpsin的作用下都會產(chǎn)生diGly位點?;谶@一特異性,利用針對蛋白質翻譯后修飾(PTM)基序(motif)抗體,在肽段水平上免疫親和富集帶有泛素化修飾的肽段,利用液相色譜-串聯(lián)質譜(LC-MS/MS)進行定量分析,能夠快速、準確、高通量地分析多種疾病相關信號通路關鍵節(jié)點蛋白修飾的變化,滿足創(chuàng)新性研究、生物標志物鑒定、藥物靶點篩選和評價的需求。蛋白質翻譯后修飾組學在細胞生物學以及疾病診斷和預防研究中至關重要。

泛素化修飾蛋白質組學:泛素是一種由76個氨基酸組成的多肽,在真核生物中高度保守,可通過異肽鍵與目標蛋白賴氨酸殘基的氨基進行共價連接。泛素化蛋白的富集主要基于標記,泛素用親和標簽(通常為6xHis)進行標記,并通過鎳螯合色譜親和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端為Arg-Gly-Gly結構,經(jīng)胰蛋白酶水解后,Gly-Gly保留在修飾蛋白的肽鏈上,使肽的質量增加114,因此可作為泛素定位位點的質量標記。用HPLC對樣品進行預分離,使用針對特定殘留結構的抗體富集泛素化肽,可很大程度上提高泛素化蛋白的濃度。串聯(lián)質譜可以鑒定泛素化位點。大多數(shù)翻譯后修飾蛋白以低化學計量和豐度存在,這限制了在分析全細胞裂解液時對其的檢測。貴陽丙二?;揎椀鞍踪|組學分析

蛋白質的磷酸化修飾是生物體內比較重要的共價修飾方式之一。貴陽丙二?;揎椀鞍踪|組學分析

泛素化修飾蛋白質組產(chǎn)品介紹:泛素化修飾(Ubiquitylation)是一種常見的蛋白質翻譯后修飾,是指一個或多個泛素分子(Ubiquitin,由76個氨基酸組成的多肽)在一系列特殊的酶作用下,將細胞內的蛋白質分類,從中選出靶蛋白分子,并對靶蛋白進行特異性修飾的過程。 泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾,泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導了真核生物80%~85%的蛋白質降解。除參與蛋白質降解之外,泛素化修飾還參與了細胞周期、增殖、細胞凋亡、分化、轉錄調控、基因表達、轉錄調節(jié)、信號傳遞、損傷修復、炎癥免疫等幾乎一切生命活動的調控。泛素化、心血管等疾病的發(fā)病密切相關。因此,作為近年來生物化學研究的一個重大成果,它已然成為研究、開發(fā)新藥物的新靶點。貴陽丙二?;揎椀鞍踪|組學分析

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